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HCoV-229E和HCoV-OC43都是在1960年代發(fā)現(xiàn)的搖籃,多年來一直被*為引起普通感冒的原因技術,并在一生中引起頻繁的再感染。在成年人中推動,這些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4%至15%相對較高,在高峰期高達35%。兒童的年發(fā)病率達到8%開展研究,發(fā)病率高達20%姿勢。據報道,成人中229E和OC43病毒的感染頻率為每年每100人15至25人不等首要任務,其中有80%的感染者是先前具有該感染病毒抗體的人綠色化。
NCBI收錄序列為KX344031.1,全長30713bp發展,基因編碼5個結構蛋白:S保持穩定,M,N面向,HE和E支撐作用。
- S蛋白(spike protein)穿過病毒膜,并在冠狀病毒“冠狀”中形成特征性的尖峰建設項目。它被高度糖基化最為突出,可能形成同源三聚體,并介導受體結合和與宿主細胞膜融合相結合。刺激中和抗體的主要抗原以及細胞毒性淋巴細胞的重要靶標在S蛋白上高效化。
- M蛋白(membrane glycoprotein)具有一個短的N末端結構域,該結構域在包膜的外表面上突出并跨過該包膜3次為產業發展,在包膜內留有一個長的C末端範圍和領域。M蛋白在病毒裝配中起重要作用有所增加。
- 核衣殼蛋白N(nucleocapsid phosphoprotein)與RNA基因組結合形成核衣殼。它可能參與病毒RNA合成的調控更高要求,并可能在病毒出芽過程中與M蛋白相互作用越來越重要的位置。
- HCoV-OC43中發(fā)現(xiàn)血凝素酯酶糖蛋白(HE)。血凝素部分與宿主細胞表面的神經氨酸結合的可能性,可能使病毒初吸附到膜上不要畏懼。酯酶從神經氨酸裂解乙酰基措施。冠狀病毒的HE基因與C型流感HE糖蛋白具有序列同源性大大縮短,可能反映了這兩種病毒之間的早期重組。
- 小包膜E(envelope protein)蛋白將其C末端留在包膜內緊密相關,然后跨越該包膜或彎曲并在內部投射其N末端更默契了。
根據CDC和WHO的介紹,針對HCoV-OC43的核酸診斷一般是針對RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)培訓、Gene N和Gene E不合理波動, Gene S更多用于對應藥物和疫苗的開發(fā)。
以往針對試劑盒檢測限的性能評價重要工具,一般是選擇體外轉錄的RNA積極拓展新的領域、或者臨床陽性病毒來作為標準品,用于性能評價更優質。但是兩者都具有很明顯的確定相對開放,首先體外轉錄的RNA,一般是很純脫穎而出,單一拓展應用,不涉及提取,不符合臨床病毒的微環(huán)境結構,因此必然造成檢測靈敏度被高估管理,這也是存在高概率假陰性的主要原因;再次臨床陽性病毒能力建設,即使是滅活的病毒模樣,也是存在很大的生物安全隱患,因此要求實驗室級別為P3-P4服務,大部分開發(fā)診斷試劑盒單位都不滿足改要求很重要,另外臨床陽性病毒也是來源很有限,不能被穩(wěn)定供應覆蓋,反復用于試劑盒的性能評價服務效率。
因此,有病毒的完整包膜結構,有HCoV-OC43對應的核酸序列統籌發展,但是生物安全風險較低的假病毒標準品,完美的克服了如上的缺點追求卓越,非常適合用于核酸診斷性能評價的標準品逐漸完善。
科佰生物開發(fā)了基于NCBI公布序列的假病毒產品,用于各診斷試劑盒的性能評價合理需求,其對應的優(yōu)點如下:
- hCov-OC43-N 假病毒標準品是目前主流,區(qū)別于以往體外合成的RNA、臨床陽性活病毒高質量,完美克服兩者的缺點充分發揮,真正適合用于試劑盒的性能評價,包含檢測限管理、特異性設計,重復性等;
- 根據HCoV-OC43冠狀病毒的特點改進措施,選取了RdRp(RNA-dependent RNA polymerase)就此掀開、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合計3個區(qū)段的序列今年,用于假病毒的包裝穩步前行,3個區(qū)段很好的表征了HCoV-OC43的特征序列;
- 科佰生物設計了ddPCR體系的引物動手能力、探針序列逐步改善,可不需要構建標準曲線的前提下完成對假病毒的QC拷貝數(shù)檢測,非常準確表征標準品的拷貝數(shù)提升,而且克服了Q-PCR分析CT值的相對判斷標準的不準確性大大提高;
- hCov-OC43-N 假病毒標準品,無致病性應用前景,可再生有很大提升空間,質控方法可靠,批次間穩(wěn)定首次,可以長期穩(wěn)定制備和供應可能性更大,而且要求實驗室生物安全級別為P2,滿足很多單位的安全需求搖籃。